ご供養・ご祈祷
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永代供養大祖堂内の祠堂殿にお位牌を安置し、施主様の参詣が無くとも、永久継続的に毎朝夕の勤行時に戒名（法名）を読み上げ御供養をいたします。生前の供養も受付しております。
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納骨供養御開山瑩山禅師のご霊廟であります伝燈院の傍らに建つ放光堂（納骨堂）で、御遺骨（分骨）を納めて御供養をいたします。永代供養と併せての御供養も受付しております。
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全国残骨灰精霊供養荼毘に付され、収骨後に火葬場に残された御遺骨（残骨）を御供養するために、自然サイクル保全事業協同組合により、境内に「全国火葬場残骨灰諸精霊永代供養塔」が建立されています。毎年9月に法要か営まれるほか、御供養の読経も随時受付致しております。
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三宝大荒神ご祈祷本山の守護である三宝大荒神の尊前でご祈祷を行います。日本海に面した能登半島にある總持寺祖院では、古来より人々の往来が盛んで海上安全等のご祈祷が行われておりました。毎日欠かさず早朝に行われる荒神諷経のほか、各種ご祈祷も随時受付致しております。